W 1859 r. synagoga padła ofiarą wielkiego pożaru, który zniszczył większą część Brodów. Na początku XX wieku przeprowadzono remont, W połowie lat 60. XX w. przeprowadzono remont budynku, pomieszczenia synagogi przystosowano na magazyny. Ze względu na ciągłe przeciekanie dachu budynek przestał być użytkowany, co doprowadziło do szybkiej destrukcji.